1. 尿液粘多糖定量和电泳：标本最好用晨尿，可以发现粘多糖量增加，每一型对应有不同类型的粘多糖，如Ⅰ型和Ⅱ型发现硫酸皮肤素和硫酸类肝素条带，Ⅲ型患者发现硫酸类肝素条带，Ⅳ型患者发现硫酸角质素条带。Ⅲ型和Ⅳ型患者的尿液粘多糖电泳容易出现假阴性的现象。

2. X线片：正位胸片可发现肋骨似“飘带样”；侧位脊柱片显示胸腰椎椎体发育不良，有“鸟嘴样”突起；左手正位片显示掌骨近端变尖，各指骨似“子弹头”样。

3. 头颅CT或者MRI：可发现高压性交通性脑积水导致的脑室增大。

4. 外周血溶酶体酶活性测定： 可选取的标本有外周血白细胞，皮肤成纤维细胞和血浆。粘多糖贮积症Ⅰ型患者该酶活性明显降低。

5. 溶酶体酶相关基因的突变检测：以目前的技术手段，绝大部分患者都应该检出到突变。