第十届北京罕见病学术大会暨2022京津冀罕见病学术大会征文(137)

¹天津医科大学

²天津市儿童医院（天津大学儿童医院），天津市儿科研究所，天津市儿童出生缺陷防治重点实验室

³天津市儿童医院肾脏科

支秀芳¹，张新杰²，王欣³，董妍¹，舒剑波²，王文红³，蔡春泉²

通讯作者:蔡春泉

目的：肾消耗病（Nephronophthisis，NPHP）是一种常染色体隐性囊性肾病，以肾小管损伤为特征，常导致终末期肾病。本研究通过对一名中国肾病男孩的全基因组测序的再分析，鉴定出NPHP3基因中的一个内含子c.3813-3A>G，并探究该变异对mRNA剪接的影响。

方法：我们报告一例中国4岁男孩因持续性贫血入院。采用全外显子组测序(WES)来确定候选变异。通过软件（三个硅剪接工具）预测了内含子变异对mRNA剪接的影响。此外，我们进行了体外minigene实验，验证该内含子变异的有害影响。

结果：患者表现为严重贫血、肝肾功能不全。经检查还发现双侧胸腔积液、盆腔积液及眼底异常。WES在先证者中鉴定出一个纯合子的NPHP3变异c.3813-3A>G (NM_153240.4)。所有的剪接位点预测软件和minigene体外实验均表明，该变异对NPHP3基因mRNA的正常剪接模式均有影响。具体来说，该变异激活了一个潜在的内含子剪接受体，导致在26和27外显子之间的编码区插入2bp的碱基，从而导致读码框帧移，从而导致翻译的提前终止。

结论：我们的研究证实了c.3813-3A>G变异对NPHP3体外剪接的影响，为该变异的临床意义提供了额外的证据，为肾消耗病的遗传学诊断提供了依据。此外，我们认为当临床信息进一步完善后，WES数据的重新分析是十分必要的，以避免遗漏一些重要的候选变异。

建议在完整的临床信息收集后对WES数据进行分析，以避免遗漏一些重要的候选变异。