作者:张泽丹 等 日期:2025-02-18 浏览量:84
第十二届北京罕见病学术大会暨2024京津冀罕见病学术大会征文(058)
1、北京大学第一医院泌尿外科
2、北京大学第一医院实验中心
张泽丹1,邱建辉1,王艺宙2,龚侃1
目的:Von Hippel-Lindau(VHL)综合征是一种罕见的常染色体显性遗传肿瘤疾病,其中肾癌是患者死亡的主要原因之一。本研究拟探究VHL综合征肾癌微环境成纤维细胞(CAF)的异质性,以期在这类罕见疾病中发现潜在的治疗靶点和改善治疗策略。
方法:收集10位VHL综合征肾癌患者的术后16例肿瘤及10例配对癌旁组织样本进行单细胞转录组测序,使用CellRanger软件生成基因细胞矩阵。数据处理包括使用Seurat包进行过滤、标准化和PCA降维,通过SoupX去除环境RNA污染,DoubletFinder去除双细胞,以及利用Harmony包消除批次效应。UMAP技术用于可视化并注释细胞类型,同时利用SCENIC、scVelo和CellChat R包进行转录因子调控、细胞分化和细胞通讯分析。多色免疫荧光验证差异存在,流式分选筛选目标细胞亚群,并通过体外共培养及体内成瘤实验研究其对肿瘤细胞行为的影响。
结果:通过对该类罕见肾癌的微环境整体解析,共鉴定出13个大类细胞群。其中,成纤维细胞可分为9个亚群,多数高表达平滑肌肌动蛋白,提示肌成纤维细胞是该类肾癌微环境的主要成纤维细胞类型,这与散发肾癌的成纤维细胞组成相似。与癌旁组织相比,肿瘤组织中富集高表达脂代谢相关的FABP5、STEAP4和S100A4的CAF亚群,而癌旁组织富集RERGL阳性纤维细胞亚群。通路分析显示,FABP5+ CAF亚群多条致癌通路上调,其占比与患者不良预后相关。进一步分析表明,FABP5+ CAF亚群可能源自癌旁RERGL+ 纤维细胞亚群,受FOSB、ALX4等转录因子调控分化而来。多色免疫荧光验证了FABP5+ CAF亚群在肿瘤组织中的富集和定位。体外和裸鼠实验证实,FABP5+ CAF亚群能显著促进肿瘤细胞的迁移、侵袭和成瘤能力。进一步的细胞通讯分析表明,FABP5+ CAF亚群可能通过VCAM1/VLA-4配体受体与肿瘤细胞特异性互作,从而促进肿瘤进展。
结论:本研究通过单细胞测序全面描绘了罕见VHL综合征肾癌肿瘤微环境的细胞图谱,并首次明确了FABP5+ CAF亚群在该类罕见肿瘤进展中的促进作用。这一发现不仅为VHL综合征肾癌的诊断和治疗提供了新的潜在标志物和干预靶点,也为其他类型肿瘤微环境的研究提供了新的思路和方向。
关键词:
VHL综合征,肾癌,单细胞转录组学,成纤维细胞,