作者:张天誉 等 日期:2024-10-28 浏览量:204
第十二届北京罕见病学术大会暨2024京津冀罕见病学术大会征文(021)
张天誉 王薇 高思豪 王伟 马明圣 宋红梅
北京协和医院
目的:探索I型IFN病与儿童SLE的差异表达基因
方法:本研究为回顾性研究,将初发儿童SLE与初发I型IFN病患者的外周血进行转录组测序,寻找经典型SLE与I型IFN病的差异表达基因,并进行相关通路注释。将差异表达基因进行层次聚类,探索与临床表型的关系
结果:本研究共收集了15例初发SLE及6例I型IFN病外周血进行转录组测序,6例I型IFN病患者均为AGS(Aicardi-Goutières syndrome),SLE与I型IFN病患者外周血的转录组测序分析得到787个差异表达基因,通过Reactome及KEGG通路富集结果显示两组在I型IFN通路上并无显著差异,在中性粒细胞介导的相关通路中较显著。787个差异表达基因与459个ISGs有19个重叠基因:LIF,MMP9,HLA−DQB1,ITGB3,CCL3L1,PDCD1,PF4,CXCR3,CDKN2A,HLA−DRB1,AKT1,HLA−DRB5,MYD88,MAPK3,BAHD1,CD27,CD3E,TGFB1,ILF3,其中ILF3在I型IFN病中表达上调。因大部分差异表达基因均在SLE患者中表达上调,根据787个差异表达基因通过层次聚类分析将SLE患儿聚类为4组,未发现与受累系统及疾病活动度的明显相关性。
结论:(1)SLE与I型IFN病患者中的差异表达基因主要富集在中性粒细胞介导的相关通路,所以中性粒细胞介导的免疫反应可能在SLE发病机制中起重要作用。(2)I型IFN疾病与SLE差异表达ISGs有19个,其中ILF3在I型IFN病中表达上调。
关键词:儿童,SLE,I型IFN病,临床表现,转录组测序